A pesar de que han pasado más de 48 horas desde la aprobación de la reforma al Poder Judicial por parte de Morena y sus aliados en la Cámara de Diputados, los resultados de las votaciones aún no se han publicado en la Gaceta Parlamentaria, lo que contraviene el reglamento del recinto legislativo. La reforma fue aprobada el miércoles 4 de septiembre, tras casi 20 horas de debate, con 359 votos a favor y 135 en contra en lo general, y 357 votos a favor y 130 en contra en lo particular. Sin embargo, hasta el 6 de septiembre, los resultados no aparecían en la página oficial de la Cámara, lo cual fue señalado por el Partido Revolucionario Institucional (PRI), sumando esto a las denuncias de la oposición sobre presuntas irregularidades en el proceso.
Entre las anomalías señaladas por la oposición están el hecho de que la discusión de la reforma ocurrió pese a existir dos suspensiones provisionales que ordenaban lo contrario, y el cambio de sede a la Sala de Armas de la Magdalena Mixhuca debido a la ocupación de San Lázaro por trabajadores del Poder Judicial. La oposición también cuestiona el registro del quórum legal debido a los obstáculos logísticos para acceder a la sede alterna y la falta de un tablero electrónico para registrar asistencias, lo que generó dudas sobre si la sesión inició con el número mínimo requerido de legisladores.
Otra acusación es que legisladores de Morena supuestamente abandonaron sus lugares durante la sesión, dejando a asesores, ayudantes y choferes para simular que se mantenía el quórum legal, lo cual, según la oposición, afectó la legitimidad del proceso.
En respuesta, Ricardo Monreal, coordinador de Morena y presidente de la Junta de Coordinación Política de la Cámara, aseguró que el proceso legislativo fue intachable y cumplió con los plazos y pasos que la ley establece, pese a las críticas.
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